Naturalis presenteert een museum vol natuur. Temidden van miljoenen jaren oude fossielen paraderen twee dinosauriërs, een 9 meter lange maashagedis, een oerpaardje en een mammoet. Opgezette apen, roofdieren, vlinders, kevers, vissen, vogels, planten, mineralen en gesteenten tonen de geweldige variatie in de natuur. In de actie-expositie 'Kijkje Aarde' leren kinderen al spelend hoe de natuur werkt. Een speciale schatkamer bevat edelstenen en zeldzame dieren, de geheimen van de evolutie worden onthuld en voor wie nog veel meer van de natuur wil weten, is er een Natuur Informatie Centrum.
Verder is Naturalis nabij de volgende bezienswaardigheden: Museum Volkenkunde (±600 m), Hortus botanicus Leiden (±1,1 km), CORPUS reis door de mens (±1,6 km) & Stoomtrein Katwijk-Leiden (±2,1 km).